РЗН 2020/12162

Набор реагентов PraxisTM Extended RAS Panel для качественного определения статуса специфических мутаций генов RAS (KRAS (экзоны 2, 3 и 4) и NRAS (экзоны 2, 3 и 4)) методом секвенирования нового поколения в пробе геномной ДНК человека, выделенной из образцов тканей колоректального рака, фиксированных в формалине, и заключенных в парафиновые блокив составе:
I. Реагенты для пре- и пост- амплификации, коробка 1:
1. Реагенты для пре-амплификации (Pre-Amp Reagents), коробка 1 А:
1.1. Буфер для гибридизации (Hybridization Buffer) - 1 пробирка (4,32 мл/пробирка).
1.2. Смесь для удлиннения-лигирования (Extension-Ligation Mix) - 1 пробирка (4,8 мл/пробирка).
1.3. Праймеры индексированные A (А501) - H (А508) (Index Primers A (A501) - H (А508)) - 1 пробирка для каждого праймера (192 мкл/пробирка).
1.4. Праймеры индексированные 1 (A701) - 12 (A712) (Index Primers 1 (A701) - 12 (A712)) - 1 пробирка для каждого праймера (128 мкл/пробирка).
1.5. ПЦР полимераза (PCR Polymerase) - 1 пробирка (56 мкл/пробирка).
1.6. Смесь для ПЦР (PCR Master Mix) - 1 пробирка (2,8 мл/пробирка).
2. Реагенты для пост-амплификации (Post-Amp Reagents), коробка 1 B:
2.1. Разбавитель для разведения библиотек при нормализации (Library Normalization Diluent) - 1 пробирка (4,6 мл/пробирка).
2.2. Буфер для разведения библиотек (Library Dilution Buffer) - 2 пробирки (4,5 мл/пробирка).
2.3. Контроль внутренний PhiX (PhiX Internal Control) - 1 пробирка (10 мкл/пробирка).
II. Реагенты для пост-амплификации (Post-Amp Reagents), коробка 2:
1. Картридж MiSeqТМ Dx SBS v3 (MiSeqТМ Dx SBS Cartridge v3) - 2 шт.
III. Реагенты для пре- и пост- амплификации, коробка 3:
1. Реагенты для пре-амплификации (Pre-Amp Reagents), коробка 3 А:
1.1. Буфер для интенсивной отмывки (Stringent Wash Buffer) - 1 флакон (24 мл/флакон).
1.2. Буфер универсальный, промывочный (Universal Wash Buffer) - 1 пробирка (4,8 мл/пробирка).
2. Реагенты для пост-амплификации (Post-Amp Reagents), коробка 3B:
2.1. Микрочастицы для очистки ПЦР-продуктов (PCR Clean-Up Beads) - 1 пробирка (5 мл/пробирка).
2.2. Раствор промывочный для нормализации библиотек (Library Normalization Wash) - 2 пробирки (4,8 мл/пробирка).
2.3. Микрочастицы для библиотеки (Library Beads) - 1 пробирка (1,2 мл/пробирка).
2.4. Ячейка проточная MiSeqТМ Dx (MiSeqТМ Dx Flow Cell) - 2 резервуара (1 ячейка на резервуар).
IV. Реагенты для пост-амплификации (Post-Amp Reagents), коробка 4:
1. Буфер MiSeqТМ Dx SBS (PR2) (MiSeqТМ Dx SBS Solution (PR2)) - 2 флакона (500 мл/флакон).
V. Реагенты для пре- и пост-амплификации, коробка 5:
1. Реагенты для пре-амплификации (Pre-Amp Reagents), коробка 5:
1.1. Планшет фильтровальный TruSeqTM Custom Amplicon Dx (TruSeqTM Custom Amplicon Dx Filter Plate) - 2 шт.
2. Реагенты для пост-амплификации (Post-Amp Reagents), коробка 5:
2.1. Буфер для элюции (Elution Buffer) - 1 пробирка (4,8 мл/пробирка).
2.2. Буфер для хранения библиотек (Library Storage Buffer) - 1 пробирка (3,5 мл/пробирка).
VI. Реагенты для пре-амплификации (Pre-Amp Reagents), коробка 6:
1. Пул праймеров A (Oligo Pool A - Extended RAS) - 1 пробирка (150 мкл/пробирка).
2. Пул праймеров B (Oligo Pool B - Extended RAS) - 1 пробирка (150 мкл/пробирка).
3. Праймеры контрольные для проверки качества (QC Primers) - 4 пробирки (75 мкл/пробирка).
4. ДНК контрольная для проверки качества (QC Template) - 1 пробирка (220 мкл/пробирка).
5. Смесь для количественной ПЦР (qPCR Master Mix) - 2 пробирки (1 мл/пробирка).
6. Библиотека контрольная RAS (Panel Control - Extended RAS) - 1 пробирка (8 мкл/пробирка).
VII. Инструкция по применению - 1 шт.
VIII. Руководство справочное - 1 шт.
IX. Руководство справочное для программного обеспечения Local Run Manager для модуля анализа PraxisTM Extended RAS Panel - 1 шт.