РК-МТ-7№013890

Тип

МИ

Дата регистрации

02.12.2014

Дата истечения

02.12.2021

Рег.номер каз

ҚР-МТ-7№013890

Вид регистрации

Регистрация

Срок регистрации

7

Срок хранения

0

Торговое название

Система анализа последовательности молекул ДНК "Personal Genome Machine", (PGM) с принадлежностями

Торговое название каз

ДНҚ молекулалары бірізділігін талдау жүйесі "Personal Genome Machine", (PGM) керек-жарақтарымен

Назначение

Система анализа последовательности молекул ДНК "Personal Genome Machine", с принадлежностями, разработана для анализа последовательности ДНК (секвенирования) из медицинских, судебно-медицинских и других биологических образцов с целью поиска любых вариаций в геномной ДНК и кДНК, а также для анализа и тестирования причин заболеваний, поиска новых возможных мишеней для терапии.

Область применения

В клинико-диагностических, судебно-медицинских и медицинских лабораториях

Класс безопасности

Класс 2 а – со средней степенью риска

Краткая техническая характеристика

Метод секвенирования Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения рН в результате встраивания нуклеотидов Субстрат для секвенирования Секвенирование клонально амплифицированных фрагментов ДНК на поверхности микрочастиц, помещенных в лунки внешнего слоя одноразового полупроводникового сенсорного микрочипа. Количество высококачественных, отфильтрованных нуклеотидов, считываемых системой за один типичный запуск прибора (определяется типом используемого микрочипа) Более1 млрд. пар оснований (318-й микрочип, 12 млн. сенсоров); более 200 млн. пар оснований (316-й микрочип 6 млн. сенсоров); более 20 млн. пар оснований (314-й микрочип 1,2 млн. сенсоров) Длина прочтения Прямые прочтения: 100-150 п.н. 200-220 п.н. Парноконцевые прочтения: 2?100 п.н.; 2?200 п.н. Длительность одного запуска прибора 314 чип: 1,5 часа - 100 п.н.; 2,4 часа - 200 п.н.; 316 чип: 1,7 часа - 100 п.н.; 3,1 часа - 200 п.н.; 318 чип: 2,4 часа - 100 п.н.; 4,5 часа - 200 п.н. Точность прочтения каждого фрагмента Более 99,5% Точность консенсуса (6-кратное прочтение) 99,99% Количество прочитываемых одноцепочечных фрагментов ДНК за один запуск прибора Около 6 млн. фрагментов (318-й микрочип, 12 млн. сенсоров); около 2 млн. фрагментов (316-й микрочип 6 млн. сенсоров); около 0,1 млн. фрагментов (314-й микрочип 1,2 млн. сенсоров) Возможное количество одновременно исследуемых библиотек ДНК (образцов) за один запуск 32 (при использовании молекулярных штрихкодов) "мультиплекс", 32 молекулярных штрихкодов Возможности программного обеспечения, поставляемого вместе с системой: oСборка геномов de novo; oАнализ метагеномов (секвенирование 16S рибосомальной ДНК) oКартирование фрагментов ДНК на референсный геном при ресеквенировании, выявление SNP и изучение структурных вариаций (инсерций, делеций, повторов); oАнализ транскриптома; oАнализ ампликонов; oАнализ результатов экспериментов ChIP-Seq, RNA-Seq, RIP-Seq, MeDIP (анализ метилирования). Размеры Ширина 61 см Глубина 51 см Высота 53 см Вес (в упаковке) 30 кг (39 кг) Параметры окружающей среды Температура 15°С-25°С Влажность 40-60% Высота менее 2000 м над уровнем моря Параметры электропитания 100-240 В, не более 9 А, 50/60 Гц.

Краткая техническая характеристика каз

Метод секвенирования Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения рН в результате встраивания нуклеотидов Субстрат для секвенирования Секвенирование клонально амплифицированных фрагментов ДНК на поверхности микрочастиц, помещенных в лунки внешнего слоя одноразового полупроводникового сенсорного микрочипа. Количество высококачественных, отфильтрованных нуклеотидов, считываемых системой за один типичный запуск прибора (определяется типом используемого микрочипа) Более1 млрд. пар оснований (318-й микрочип, 12 млн. сенсоров); более 200 млн. пар оснований (316-й микрочип 6 млн. сенсоров); более 20 млн. пар оснований (314-й микрочип 1,2 млн. сенсоров) Длина прочтения Прямые прочтения: 100-150 п.н. 200-220 п.н. Парноконцевые прочтения: 2?100 п.н.; 2?200 п.н. Длительность одного запуска прибора 314 чип: 1,5 часа - 100 п.н.; 2,4 часа - 200 п.н.; 316 чип: 1,7 часа - 100 п.н.; 3,1 часа - 200 п.н.; 318 чип: 2,4 часа - 100 п.н.; 4,5 часа - 200 п.н. Точность прочтения каждого фрагмента Более 99,5% Точность консенсуса (6-кратное прочтение) 99,99% Количество прочитываемых одноцепочечных фрагментов ДНК за один запуск прибора Около 6 млн. фрагментов (318-й микрочип, 12 млн. сенсоров); около 2 млн. фрагментов (316-й микрочип 6 млн. сенсоров); около 0,1 млн. фрагментов (314-й микрочип 1,2 млн. сенсоров) Возможное количество одновременно исследуемых библиотек ДНК (образцов) за один запуск 32 (при использовании молекулярных штрихкодов) "мультиплекс", 32 молекулярных штрихкодов Возможности программного обеспечения, поставляемого вместе с системой: oСборка геномов de novo; oАнализ метагеномов (секвенирование 16S рибосомальной ДНК) oКартирование фрагментов ДНК на референсный геном при ресеквенировании, выявление SNP и изучение структурных вариаций (инсерций, делеций, повторов); oАнализ транскриптома; oАнализ ампликонов; oАнализ результатов экспериментов ChIP-Seq, RNA-Seq, RIP-Seq, MeDIP (анализ метилирования). Размеры Ширина 61 см Глубина 51 см Высота 53 см Вес (в упаковке) 30 кг (39 кг) Параметры окружающей среды Температура 15°С-25°С Влажность 40-60% Высота менее 2000 м над уровнем моря Параметры электропитания 100-240 В, не более 9 А, 50/60 Гц.

Признаки

Комментарий к сроку хранения